Республиканское государственное предприятие Научный центр противоинфекционных препаратов» было создано в 2004 году в соответствии с постановлением Правительства РК в целях научно-технического обеспечения развития отечественной фармацевтической промышленности. Этим же постановлением утверждена научно-техническая программа «Разработка новых противоинфекционных препаратов на 2004-2007г.г.».
Согласно постановлению Правительства Республики Казахстан №706 от 31.05.2012г. Республиканское государственное предприятие на праве хозяйственного ведения «Научный центр противоинфекционных препаратов» Министерства индустрии и новых технологий реорганизовано в Акционерное общество «Научный центр противоинфекционных препаратов» со 100% государственным участием в уставном капитале.