Лаборатория микробиологии исследует антибактериальный эффект новых противоинфекционных препаратов с использованием бактериальных культур и инфекционных моделей и безопасность лекарственных средств посредством определения мутагенной активности лекарственных средств на бактериях. Лаборатория аккредитована в соответствии со стандартами СТ РК ИСО 9001-2009 «Система менеджмента качества. Требования» и ГОСТ ИСО/МЭК 17025-2007 «Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий» (аттестат аккредитации № KZ И.02.1252 от 26.12.2011 г.), в 2016 году – в Федеральном бюро Германии по стандартам надлежащей лабораторной практики (GLP).
В штате лаборатории два магистра технических наук по специальности
«Биотехнология», один магистр техники и технологии по специальности «Биотехнология» и один магистр естественных наук.